《世界奇妙物语 2012年秋之特别篇》分为以下几个故事：《灵异APP》：美丽女孩立花纱织迷上了能拍出灵异照片的手机软件“灵异APP”，可是在一次升级后，所有被拍照的人都离奇死去。《来世不动产》：中年男子从昏迷中醒来，进入了来世不动产公司，他必须根据日常的善恶行为决定能否再投人身。《水龙头》：每当身边有人过世，浅村雄一的周围就会出现一个喷血的水龙头。这天妻子中毒住院，水龙头再次出现。《拼桌恋人》：25岁OL山田铃一直与从高中时代交往的恋人同居，某晚她在咖啡厅独进晚餐，对面却坐下一名自称她恋人的陌生老人。《仇恨病毒》：未来世界，人类可以通过注射疫苗消除仇恨疫苗，熄灭争端。感染检察官佐伯诚曾被杀害女儿，如今同一个犯人又杀了他的妻子。